Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFDP00746 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFDP00746 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CFDP00746 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFDP00746 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFDP00746 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFDP00746 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFDP00746 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFDP00746 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CFDP00746 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFDP00746 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFDP00746 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFDP00746 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFDP00746 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CFDP00746 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CFDP00746 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CFDP00746 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CFDP00746 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CFDP00746 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CFDP00746 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CFDP00746 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CFDP00746 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CFDP00746 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CFDP00746 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CFDP00746 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CFDP00746 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CFDP00746 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CFDP00746 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CFDP00746 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CFDP00746 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CFDP00746 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CFDP00746 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CFDP00746 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CFDP00746 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CFDP00746 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms