Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EGFRP00533 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EGFRP00533 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EGFRP00533 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EGFRP00533 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EGFRP00533 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EGFRP00533 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EGFRP00533 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EGFRP00533 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EGFRP00533 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EGFRP00533 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EGFRP00533 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EGFRP00533 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EGFRP00533 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EGFRP00533 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EGFRP00533 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EGFRP00533 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EGFRP00533 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EGFRP00533 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EGFRP00533 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EGFRP00533 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EGFRP00533 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EGFRP00533 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EGFRP00533 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EGFRP00533 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EGFRP00533 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EGFRP00533 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EGFRP00533 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EGFRP00533 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EGFRP00533 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EGFRP00533 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EGFRP00533 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EGFRP00533 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EGFRP00533 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EGFRP00533 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EGFRP00533 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EGFRP00533 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EGFRP00533 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EGFRP00533 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
EGFRP00533 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EGFRP00533 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EGFRP00533 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EGFRP00533 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EGFRP00533 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EGFRP00533 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EGFRP00533 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EGFRP00533 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EGFRP00533 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EGFRP00533 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EGFRP00533 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EGFRP00533 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EGFRP00533 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EGFRP00533 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EGFRP00533 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EGFRP00533 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EGFRP00533 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EGFRP00533 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EGFRP00533 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EGFRP00533 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EGFRP00533 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EGFRP00533 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms