Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX6O95503 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CBX6O95503 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CBX6O95503 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX6O95503 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX6O95503 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX6O95503 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX6O95503 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX6O95503 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX6O95503 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX6O95503 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX6O95503 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX6O95503 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX6O95503 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX6O95503 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX6O95503 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX6O95503 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX6O95503 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX6O95503 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX6O95503 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX6O95503 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX6O95503 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CBX6O95503 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX6O95503 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX6O95503 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX6O95503 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX6O95503 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX6O95503 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX6O95503 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX6O95503 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX6O95503 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX6O95503 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX6O95503 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX6O95503 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX6O95503 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms