Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN4O95460 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN4O95460 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN4O95460 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN4O95460 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN4O95460 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN4O95460 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN4O95460 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN4O95460 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN4O95460 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN4O95460 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN4O95460 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN4O95460 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN4O95460 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN4O95460 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN4O95460 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN4O95460 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN4O95460 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN4O95460 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN4O95460 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN4O95460 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN4O95460 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN4O95460 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN4O95460 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN4O95460 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN4O95460 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN4O95460 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN4O95460 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN4O95460 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN4O95460 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN4O95460 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN4O95460 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN4O95460 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN4O95460 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN4O95460 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN4O95460 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN4O95460 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN4O95460 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN4O95460 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN4O95460 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN4O95460 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN4O95460 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN4O95460 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MATN4O95460 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN4O95460 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN4O95460 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN4O95460 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN4O95460 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN4O95460 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN4O95460 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MATN4O95460 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms