Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNUPNO95149 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNUPNO95149 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms