Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR47O94967 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR47O94967 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR47O94967 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
WDR47O94967 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR47O94967 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR47O94967 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR47O94967 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR47O94967 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR47O94967 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR47O94967 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR47O94967 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
WDR47O94967 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR47O94967 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR47O94967 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR47O94967 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR47O94967 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR47O94967 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
WDR47O94967 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR47O94967 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR47O94967 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR47O94967 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
WDR47O94967 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR47O94967 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR47O94967 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR47O94967 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
WDR47O94967 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
WDR47O94967 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR47O94967 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR47O94967 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR47O94967 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR47O94967 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR47O94967 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR47O94967 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR47O94967 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR47O94967 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR47O94967 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR47O94967 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR47O94967 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR47O94967 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR47O94967 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR47O94967 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR47O94967 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR47O94967 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR47O94967 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR47O94967 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR47O94967 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR47O94967 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR47O94967 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR47O94967 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR47O94967 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR47O94967 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR47O94967 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR47O94967 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR47O94967 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR47O94967 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR47O94967 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR47O94967 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR47O94967 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR47O94967 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR47O94967 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR47O94967 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR47O94967 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR47O94967 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms