Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PCF11O94913 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PCF11O94913 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCF11O94913 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCF11O94913 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PCF11O94913 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCF11O94913 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCF11O94913 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCF11O94913 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCF11O94913 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PCF11O94913 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCF11O94913 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCF11O94913 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCF11O94913 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCF11O94913 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCF11O94913 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
PCF11O94913 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PCF11O94913 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PCF11O94913 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PCF11O94913 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PCF11O94913 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PCF11O94913 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PCF11O94913 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PCF11O94913 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PCF11O94913 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCF11O94913 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCF11O94913 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCF11O94913 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
PCF11O94913 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PCF11O94913 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PCF11O94913 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
PCF11O94913 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCF11O94913 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
PCF11O94913 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCF11O94913 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCF11O94913 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCF11O94913 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCF11O94913 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCF11O94913 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PCF11O94913 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCF11O94913 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCF11O94913 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCF11O94913 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCF11O94913 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCF11O94913 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCF11O94913 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCF11O94913 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PCF11O94913 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCF11O94913 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCF11O94913 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCF11O94913 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCF11O94913 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCF11O94913 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PCF11O94913 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCF11O94913 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCF11O94913 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCF11O94913 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PCF11O94913 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCF11O94913 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCF11O94913 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCF11O94913 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCF11O94913 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCF11O94913 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PCF11O94913 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCF11O94913 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCF11O94913 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCF11O94913 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCF11O94913 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCF11O94913 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PCF11O94913 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PCF11O94913 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCF11O94913 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCF11O94913 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCF11O94913 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCF11O94913 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCF11O94913 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCF11O94913 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCF11O94913 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
PCF11O94913 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCF11O94913 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCF11O94913 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCF11O94913 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCF11O94913 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PCF11O94913 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms