Protein–RNA interactions for Protein: O94856

NFASC, Neurofascin, humanhuman

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFASCO94856 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NFASCO94856 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NFASCO94856 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NFASCO94856 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFASCO94856 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFASCO94856 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFASCO94856 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFASCO94856 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFASCO94856 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFASCO94856 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFASCO94856 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFASCO94856 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFASCO94856 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFASCO94856 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFASCO94856 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFASCO94856 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFASCO94856 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFASCO94856 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFASCO94856 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFASCO94856 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFASCO94856 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFASCO94856 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFASCO94856 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFASCO94856 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFASCO94856 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFASCO94856 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFASCO94856 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFASCO94856 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFASCO94856 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFASCO94856 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFASCO94856 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NFASCO94856 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFASCO94856 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFASCO94856 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFASCO94856 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFASCO94856 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFASCO94856 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFASCO94856 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFASCO94856 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFASCO94856 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFASCO94856 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFASCO94856 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFASCO94856 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFASCO94856 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFASCO94856 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFASCO94856 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFASCO94856 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFASCO94856 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFASCO94856 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFASCO94856 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFASCO94856 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFASCO94856 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFASCO94856 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms