Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK2AP2O75956 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK2AP2O75956 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK2AP2O75956 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms