Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGR5O75473 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGR5O75473 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGR5O75473 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGR5O75473 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGR5O75473 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGR5O75473 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGR5O75473 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGR5O75473 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGR5O75473 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGR5O75473 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGR5O75473 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LGR5O75473 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGR5O75473 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGR5O75473 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGR5O75473 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGR5O75473 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGR5O75473 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGR5O75473 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LGR5O75473 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGR5O75473 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGR5O75473 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGR5O75473 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGR5O75473 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGR5O75473 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGR5O75473 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LGR5O75473 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LGR5O75473 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LGR5O75473 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LGR5O75473 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LGR5O75473 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LGR5O75473 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LGR5O75473 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LGR5O75473 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LGR5O75473 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGR5O75473 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGR5O75473 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGR5O75473 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGR5O75473 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGR5O75473 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGR5O75473 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGR5O75473 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR5O75473 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR5O75473 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR5O75473 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR5O75473 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR5O75473 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR5O75473 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR5O75473 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGR5O75473 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR5O75473 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR5O75473 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR5O75473 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR5O75473 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGR5O75473 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR5O75473 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR5O75473 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGR5O75473 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGR5O75473 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms