Protein–RNA interactions for Protein: O75351

VPS4B, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4BO75351 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS4BO75351 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS4BO75351 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS4BO75351 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms