Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX2O60749 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX2O60749 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX2O60749 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX2O60749 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX2O60749 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX2O60749 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX2O60749 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX2O60749 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX2O60749 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX2O60749 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX2O60749 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX2O60749 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX2O60749 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX2O60749 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX2O60749 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX2O60749 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX2O60749 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX2O60749 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX2O60749 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX2O60749 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX2O60749 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX2O60749 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX2O60749 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNX2O60749 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNX2O60749 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms