Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOX15O60248 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOX15O60248 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOX15O60248 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SOX15O60248 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SOX15O60248 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SOX15O60248 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOX15O60248 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SOX15O60248 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SOX15O60248 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SOX15O60248 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX15O60248 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SOX15O60248 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SOX15O60248 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms