Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF14O43557 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF14O43557 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF14O43557 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms