Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COCHO43405 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COCHO43405 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COCHO43405 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COCHO43405 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COCHO43405 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COCHO43405 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COCHO43405 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COCHO43405 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COCHO43405 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COCHO43405 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COCHO43405 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COCHO43405 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COCHO43405 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COCHO43405 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COCHO43405 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COCHO43405 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COCHO43405 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COCHO43405 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COCHO43405 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COCHO43405 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COCHO43405 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COCHO43405 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COCHO43405 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COCHO43405 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COCHO43405 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COCHO43405 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COCHO43405 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COCHO43405 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COCHO43405 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COCHO43405 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COCHO43405 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
COCHO43405 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COCHO43405 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COCHO43405 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COCHO43405 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COCHO43405 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COCHO43405 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COCHO43405 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COCHO43405 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COCHO43405 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COCHO43405 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COCHO43405 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COCHO43405 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COCHO43405 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COCHO43405 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COCHO43405 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms