Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTSS1O43312 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTSS1O43312 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTSS1O43312 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms