Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MEFVO15553 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEFVO15553 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MEFVO15553 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEFVO15553 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEFVO15553 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEFVO15553 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEFVO15553 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MEFVO15553 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEFVO15553 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEFVO15553 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEFVO15553 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MEFVO15553 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MEFVO15553 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEFVO15553 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEFVO15553 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MEFVO15553 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEFVO15553 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MEFVO15553 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MEFVO15553 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEFVO15553 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEFVO15553 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEFVO15553 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEFVO15553 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEFVO15553 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEFVO15553 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MEFVO15553 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MEFVO15553 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEFVO15553 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEFVO15553 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEFVO15553 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEFVO15553 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEFVO15553 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MEFVO15553 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEFVO15553 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MEFVO15553 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEFVO15553 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEFVO15553 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEFVO15553 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEFVO15553 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MEFVO15553 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MEFVO15553 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MEFVO15553 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MEFVO15553 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEFVO15553 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEFVO15553 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEFVO15553 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEFVO15553 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MEFVO15553 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEFVO15553 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEFVO15553 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEFVO15553 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MEFVO15553 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MEFVO15553 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEFVO15553 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEFVO15553 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MEFVO15553 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEFVO15553 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEFVO15553 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEFVO15553 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEFVO15553 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MEFVO15553 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEFVO15553 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MEFVO15553 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MEFVO15553 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MEFVO15553 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEFVO15553 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEFVO15553 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEFVO15553 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MEFVO15553 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms