Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GSC2O15499 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GSC2O15499 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GSC2O15499 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GSC2O15499 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSC2O15499 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSC2O15499 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSC2O15499 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSC2O15499 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSC2O15499 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSC2O15499 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSC2O15499 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSC2O15499 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GSC2O15499 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSC2O15499 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSC2O15499 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSC2O15499 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSC2O15499 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSC2O15499 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSC2O15499 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSC2O15499 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSC2O15499 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSC2O15499 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSC2O15499 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSC2O15499 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSC2O15499 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSC2O15499 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSC2O15499 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSC2O15499 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSC2O15499 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSC2O15499 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSC2O15499 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSC2O15499 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GSC2O15499 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSC2O15499 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSC2O15499 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GSC2O15499 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSC2O15499 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSC2O15499 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSC2O15499 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSC2O15499 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSC2O15499 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSC2O15499 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSC2O15499 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GSC2O15499 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSC2O15499 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSC2O15499 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSC2O15499 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSC2O15499 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSC2O15499 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSC2O15499 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSC2O15499 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSC2O15499 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSC2O15499 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSC2O15499 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms