Protein–RNA interactions for Protein: O15397

IPO8, Importin-8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO8O15397 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IPO8O15397 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IPO8O15397 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IPO8O15397 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IPO8O15397 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IPO8O15397 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IPO8O15397 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IPO8O15397 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IPO8O15397 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IPO8O15397 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IPO8O15397 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IPO8O15397 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
IPO8O15397 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IPO8O15397 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IPO8O15397 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IPO8O15397 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IPO8O15397 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IPO8O15397 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
IPO8O15397 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IPO8O15397 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IPO8O15397 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IPO8O15397 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IPO8O15397 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IPO8O15397 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IPO8O15397 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IPO8O15397 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IPO8O15397 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IPO8O15397 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IPO8O15397 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IPO8O15397 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IPO8O15397 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IPO8O15397 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IPO8O15397 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
IPO8O15397 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IPO8O15397 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IPO8O15397 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IPO8O15397 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IPO8O15397 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IPO8O15397 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IPO8O15397 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
IPO8O15397 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IPO8O15397 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
IPO8O15397 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IPO8O15397 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IPO8O15397 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IPO8O15397 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IPO8O15397 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IPO8O15397 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IPO8O15397 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IPO8O15397 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IPO8O15397 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IPO8O15397 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IPO8O15397 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IPO8O15397 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IPO8O15397 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IPO8O15397 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IPO8O15397 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IPO8O15397 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
IPO8O15397 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IPO8O15397 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IPO8O15397 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IPO8O15397 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
IPO8O15397 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms