Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
FANCAO15360 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FANCAO15360 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
FANCAO15360 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
FANCAO15360 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
FANCAO15360 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FANCAO15360 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
FANCAO15360 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FANCAO15360 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FANCAO15360 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FANCAO15360 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
FANCAO15360 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
FANCAO15360 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FANCAO15360 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FANCAO15360 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FANCAO15360 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FANCAO15360 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
FANCAO15360 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FANCAO15360 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
FANCAO15360 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
FANCAO15360 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
FANCAO15360 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
FANCAO15360 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
FANCAO15360 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
FANCAO15360 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FANCAO15360 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FANCAO15360 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
FANCAO15360 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
FANCAO15360 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
FANCAO15360 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FANCAO15360 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FANCAO15360 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FANCAO15360 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
FANCAO15360 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FANCAO15360 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
FANCAO15360 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
FANCAO15360 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
FANCAO15360 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FANCAO15360 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FANCAO15360 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FANCAO15360 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FANCAO15360 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FANCAO15360 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FANCAO15360 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
FANCAO15360 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FANCAO15360 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
FANCAO15360 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
FANCAO15360 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
FANCAO15360 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
FANCAO15360 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
FANCAO15360 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FANCAO15360 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FANCAO15360 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
FANCAO15360 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FANCAO15360 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
FANCAO15360 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
FANCAO15360 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
FANCAO15360 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FANCAO15360 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FANCAO15360 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
FANCAO15360 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FANCAO15360 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
FANCAO15360 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FANCAO15360 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
FANCAO15360 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
FANCAO15360 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms