Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHADO15335 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHADO15335 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHADO15335 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHADO15335 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHADO15335 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHADO15335 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHADO15335 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHADO15335 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHADO15335 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHADO15335 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHADO15335 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHADO15335 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHADO15335 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHADO15335 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHADO15335 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHADO15335 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHADO15335 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHADO15335 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHADO15335 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHADO15335 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHADO15335 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHADO15335 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHADO15335 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHADO15335 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHADO15335 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHADO15335 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHADO15335 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHADO15335 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHADO15335 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHADO15335 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHADO15335 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHADO15335 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHADO15335 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHADO15335 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHADO15335 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHADO15335 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHADO15335 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms