Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BCKDKO14874 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BCKDKO14874 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms