Protein–RNA interactions for Protein: O14843

FFAR3, Free fatty acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR3O14843 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FFAR3O14843 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FFAR3O14843 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms