Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A3R1O14745 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC9A3R1O14745 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC9A3R1O14745 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC9A3R1O14745 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC9A3R1O14745 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms