Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TXNDC9O14530 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TXNDC9O14530 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TXNDC9O14530 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms