Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2CO00762 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms