Protein–RNA interactions for Protein: O00626

CCL22, C-C motif chemokine 22, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL22O00626 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL22O00626 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL22O00626 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL22O00626 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL22O00626 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL22O00626 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL22O00626 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL22O00626 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL22O00626 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL22O00626 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL22O00626 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL22O00626 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL22O00626 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL22O00626 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL22O00626 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL22O00626 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL22O00626 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL22O00626 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL22O00626 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL22O00626 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL22O00626 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL22O00626 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL22O00626 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL22O00626 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL22O00626 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL22O00626 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL22O00626 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL22O00626 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL22O00626 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL22O00626 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL22O00626 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL22O00626 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL22O00626 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL22O00626 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL22O00626 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms