Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ZNF485-203ENST00000430885 529 ntTSL 213.61□□□□□ -0.232e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ELMOD2-206ENST00000511887 751 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.393e-13■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.415e-34■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZNF181-201ENST00000392232 2791 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.556e-12■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 CORO2A-202ENST00000375077 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.672e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TM2D3-203ENST00000428002 1267 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.716e-12■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 RCBTB1-202ENST00000378302 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 58.79□□□□□ -12e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-210ENST00000478801 555 ntTSL 48.34□□□□□ -1.072e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.135e-34■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.243e-13■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TM2D3-206ENST00000559024 863 ntTSL 26.62□□□□□ -1.356e-12■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-206ENST00000460873 569 ntTSL 46.45□□□□□ -1.382e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 ZNF181-206ENST00000595708 567 ntTSL 25.99□□□□□ -1.452e-10■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-216ENST00000632034 570 ntTSL 25.57□□□□□ -1.521e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 PON2-203ENST00000446142 1099 ntTSL 1 (best)4.88□□□□□ -1.631e-87■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TNNI3-209ENST00000590463 539 ntTSL 320.43■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TNNI3-206ENST00000587176 992 ntTSL 220.43■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.654e-7■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.134e-7■■■■■ 46.2
DDX3XO00571 CASC4-204ENST00000557945 1386 ntTSL 1 (best)22.36■■□□□ 1.171e-16■■■■■ 46.1
DDX3XO00571 CASC4-203ENST00000429162 1918 ntTSL 221.47■■□□□ 1.031e-16■■■■■ 46.1
DDX3XO00571 CASC4-209ENST00000559222 742 ntTSL 319.45■□□□□ 0.71e-16■■■■■ 46.1
DDX3XO00571 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.121e-16■■■■■ 46.1
DDX3XO00571 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.131e-16■■■■■ 46.1
DDX3XO00571 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.743e-9■■■■■ 46.1
DDX3XO00571 DUSP3-202ENST00000590342 2077 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.042e-15■■■■■ 46.1
DDX3XO00571 DUSP3-201ENST00000226004 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.812e-15■■■■■ 46.1
DDX3XO00571 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.161e-12■■■■■ 46
DDX3XO00571 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.151e-12■■■■■ 46
DDX3XO00571 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.061e-12■■■■■ 46
DDX3XO00571 ZNF800-204ENST00000434602 955 ntTSL 510.71□□□□□ -0.691e-12■■■■■ 46
DDX3XO00571 ZNF800-206ENST00000439506 410 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.931e-12■■■■■ 46
DDX3XO00571 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 46
DDX3XO00571 NUDT9-207ENST00000514345 556 ntTSL 418.06■□□□□ 0.481e-7■■■■■ 46
DDX3XO00571 NUDT9-205ENST00000512216 690 ntTSL 316.55■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 46
DDX3XO00571 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 46
DDX3XO00571 PUS7-204ENST00000481939 2436 ntTSL 518.35■□□□□ 0.533e-14■■■■■ 46
DDX3XO00571 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-14■■■■■ 46
DDX3XO00571 PUS7-201ENST00000356362 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.543e-14■■■■■ 46
DDX3XO00571 C12orf49-203ENST00000547630 1371 ntTSL 1 (best)21.44■■□□□ 1.026e-7■■■■■ 46
DDX3XO00571 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 46
DDX3XO00571 ERO1A-207ENST00000556223 567 ntTSL 416.57■□□□□ 0.242e-15■■■■■ 46
DDX3XO00571 ERO1A-204ENST00000554251 555 ntTSL 516.57■□□□□ 0.242e-15■■■■■ 46
DDX3XO00571 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.173e-17■■■■■ 46
DDX3XO00571 PRDX4-205ENST00000495599 632 ntTSL 317.28■□□□□ 0.363e-17■■■■■ 46
DDX3XO00571 PRDX4-203ENST00000379349 815 ntTSL 312.04□□□□□ -0.483e-17■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 224.16■■□□□ 1.464e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)24.16■■□□□ 1.464e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.054e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.034e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.874e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-206ENST00000472277 536 ntTSL 319.32■□□□□ 0.684e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-202ENST00000461670 530 ntTSL 517.63■□□□□ 0.414e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-209ENST00000496131 962 ntTSL 314.3□□□□□ -0.124e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 ATP6V0B-207ENST00000472505 411 ntTSL 513.5□□□□□ -0.254e-13■■■■■ 46
DDX3XO00571 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.022e-8■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.057e-11■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 GPR160-208ENST00000491740 550 ntTSL 420.58■□□□□ 0.891e-10■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 GPR160-206ENST00000482813 865 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-10■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.758e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.388e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-205ENST00000504359 565 ntTSL 416.64■□□□□ 0.258e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-216ENST00000510026 2599 ntTSL 512.49□□□□□ -0.418e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-220ENST00000515326 1050 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.518e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-213ENST00000509341 572 ntTSL 511.17□□□□□ -0.628e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-212ENST00000509156 2063 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.638e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-209ENST00000507393 583 ntTSL 48.61□□□□□ -1.038e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-207ENST00000507218 1352 ntTSL 1 (best)8.35□□□□□ -1.078e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.258e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 ZNF131-210ENST00000508259 501 ntTSL 53.08□□□□□ -1.928e-13■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 326.62■■□□□ 1.852e-8■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 GPX4-208ENST00000592940 1184 ntTSL 523.2■■□□□ 1.35e-28■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.524e-8■■■■■ 45.9
DDX3XO00571 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.652e-8■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-203ENST00000571291 927 ntTSL 319.79■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-209ENST00000573520 787 ntTSL 317.24■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-214ENST00000575002 562 ntTSL 416.13■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-215ENST00000575557 431 ntTSL 313.65□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 NMRAL1-211ENST00000573571 731 ntTSL 313.3□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 45.8
DDX3XO00571 TM7SF3-211ENST00000542667 613 ntTSL 314.74□□□□□ -0.052e-15■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 ZNF562-203ENST00000585350 577 ntTSL 515.25■□□□□ 0.039e-9■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 ZNF562-208ENST00000590155 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.999e-9■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 ZNF562-207ENST00000589542 491 ntTSL 37.76□□□□□ -1.179e-9■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.29e-9■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 ZNF562-206ENST00000588653 585 ntTSL 27.51□□□□□ -1.219e-9■■■■■ 45.7
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