Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EBAG9O00559 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EBAG9O00559 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBAG9O00559 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBAG9O00559 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBAG9O00559 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBAG9O00559 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBAG9O00559 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBAG9O00559 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBAG9O00559 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EBAG9O00559 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms