Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLRMTO00411 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLRMTO00411 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLRMTO00411 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms