Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGRPO00253 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGRPO00253 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGRPO00253 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGRPO00253 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGRPO00253 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGRPO00253 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGRPO00253 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGRPO00253 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGRPO00253 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGRPO00253 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGRPO00253 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGRPO00253 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGRPO00253 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGRPO00253 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGRPO00253 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGRPO00253 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGRPO00253 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGRPO00253 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGRPO00253 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGRPO00253 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGRPO00253 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGRPO00253 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGRPO00253 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGRPO00253 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGRPO00253 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGRPO00253 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGRPO00253 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGRPO00253 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGRPO00253 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGRPO00253 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGRPO00253 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGRPO00253 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGRPO00253 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGRPO00253 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGRPO00253 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGRPO00253 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGRPO00253 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AGRPO00253 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGRPO00253 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGRPO00253 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGRPO00253 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGRPO00253 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGRPO00253 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGRPO00253 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGRPO00253 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGRPO00253 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGRPO00253 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGRPO00253 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGRPO00253 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGRPO00253 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGRPO00253 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AGRPO00253 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGRPO00253 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGRPO00253 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGRPO00253 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGRPO00253 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGRPO00253 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms