Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGPSO00116 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGPSO00116 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGPSO00116 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGPSO00116 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGPSO00116 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGPSO00116 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGPSO00116 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGPSO00116 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGPSO00116 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGPSO00116 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGPSO00116 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AGPSO00116 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGPSO00116 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGPSO00116 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGPSO00116 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPSO00116 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPSO00116 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPSO00116 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPSO00116 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPSO00116 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPSO00116 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPSO00116 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPSO00116 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPSO00116 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPSO00116 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPSO00116 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPSO00116 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPSO00116 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGPSO00116 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGPSO00116 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPSO00116 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPSO00116 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPSO00116 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPSO00116 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPSO00116 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPSO00116 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPSO00116 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPSO00116 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPSO00116 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPSO00116 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPSO00116 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPSO00116 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPSO00116 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPSO00116 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPSO00116 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPSO00116 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPSO00116 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPSO00116 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPSO00116 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPSO00116 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.6 ms