Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMIM22K7EJ46 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMIM22K7EJ46 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM22K7EJ46 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms