Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC188H7C350 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC188H7C350 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC188H7C350 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms