Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H7C0C1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H7C0C1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H7C0C1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H7C0C1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H7C0C1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H7C0C1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H7C0C1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H7C0C1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H7C0C1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H7C0C1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0C1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0C1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0C1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0C1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0C1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0C1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0C1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H7C0C1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H7C0C1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0C1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0C1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0C1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0C1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0C1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0C1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0C1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
H7C0C1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0C1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0C1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0C1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0C1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0C1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0C1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0C1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H7C0C1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H7C0C1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
H7C0C1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0C1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0C1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0C1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H7C0C1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms