Protein–RNA interactions for Protein: C9J1S8

TRIM49D1, Tripartite motif-containing protein 49D, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49D1C9J1S8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM49D1C9J1S8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM49D1C9J1S8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM49D1C9J1S8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms