Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HNRNPCL3B7ZW38 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HNRNPCL3B7ZW38 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms