Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C4orf47A7E2U8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms