Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
DBX1A6NMT0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DBX1A6NMT0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DBX1A6NMT0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms