Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM200CA6NKL6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM200CA6NKL6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms