Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIPT2A6NK58 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.4 ms