Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC154A6NI56 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC154A6NI56 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms