Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC160A6NGH7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC160A6NGH7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC160A6NGH7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms