Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C5orf60A6NFR6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C5orf60A6NFR6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C5orf60A6NFR6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms