Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM247A6NEH6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM247A6NEH6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM247A6NEH6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms