Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL33A6NCF5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL33A6NCF5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms