Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPED1A4D0V7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CPED1A4D0V7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms