Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VWA8A3KMH1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VWA8A3KMH1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms