Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC144AA2RUR9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCDC144AA2RUR9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC144AA2RUR9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms