Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FRMD3A2A2Y4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD3A2A2Y4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD3A2A2Y4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms